双博馆的前身是扬州博物馆。扬州博物馆的历史最早可追溯到1951年建立的扬州“文物馆”及同年筹建的“苏北博物馆”。经过50多年的发展，扬州博物馆已成为国际、国内颇有影响的藏品丰富、功能齐全、具有鲜明地方特色的综合性博物馆，收藏地方文物30000余件（套）。2003年8月经国务院批准成立扬州中国雕版印刷博物馆，遂将扬州广陵书社收藏的30万片古籍版片并入扬州博物馆，建立扬州双博馆。扬州双博馆工程于2003年10月18日正式开工，2004年4月15日主体工程封顶。2005年4月18日，土建工程竣工。同年10月9日，双博陈展工程竣工并全面对外开放。
